Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT3P49368 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms