Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms