Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTGIRP43119 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms