Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGCXP38435 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGCXP38435 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms