Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms