Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms