Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms