Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms