Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms