Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4AP27815 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4AP27815 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4AP27815 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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