Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms