Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA6P23229 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms