Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms