Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKACBP22694 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKACBP22694 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms