Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms