Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms