Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms