Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C8orf88P0DMB2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms