Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6DP0CG33 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms