Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSN3P07498 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSN3P07498 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms