Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms