Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEBLO76041 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEBLO76041 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEBLO76041 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms