Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms