Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC5O75140 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms