Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms