Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC11O43248 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms