Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN2O15020 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms