Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms