Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms