Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM223A0PJW6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms