Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms