Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms