Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms