Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms