Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms