Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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