Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms