Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms