Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms