Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIPA1L2Q9P2F8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1L2Q9P2F8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms