Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABI3Q9P2A4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms