Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms