Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDE1Q9NZC3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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