Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D2Q9NY47 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms