Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms