Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTLNQ9NXG0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms