Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF3Q9NRP4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms