Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms