Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms