Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A8Q9C0K1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms